公司服务器被强势木马入侵

是上个礼拜的事了，虽已平静，但还是有必要再说一下，给各位一个解决问题的方法。
早上上班，待我开完会还未进办公室门，助理及一同事推门而出：工程部电脑全部瘫痪，用我之前的杀毒利器处理不了。进门，未站定，噩耗继续传来：业务部电脑出现同样问题。
看来，这不是一般的小毒了，我也肯定又是内部把病毒通过U盘、MP3、手机、数码相机等传播来。因为目前U盘病毒大肆传播，而要命的是使用者却不能引以为戒，连最起码的判断常识都没有，因此，不能预防就无法遏制。
本次中毒的现象：电脑里的文件夹不翼而飞，如果把显示系统文件的勾勾去掉的话，你就会看到，不过这时的文件夹已经变成病毒了，而且被加了EXE的属性名，成了程序，不知者，一点循环中毒。更甚的是，有些电脑的注册表及设备管理都被禁用，任何程序都无法使用。但最关键的是：中毒的多数文件夹都是服务器里的，要命啊。
好在，只用了一个工作日，全部处理OK。至于处理的过程，我不再说因为不再重要，重要的是怎么做的。
请各位在自己电脑上装一个软件USBCleaner6.0，最好用的查杀及预防U盘类病毒的软件，更新频率高（已更新至7月11日），全免费。
http://www.usbcleaner.cn/index1.htm