三个体系和三个产品认证的体系该如何整合？

我刚到一个 公司，发现了体系的很多问题，该公司在一年半内，通过了三个体系ISO9000/ISO14000/OHSA18000还有三个产品认证TS/CE/API，现在的问题是每一个体系和产品认证都有一份对应的质量手册、一份程序文件、作业指导书或技术规范及表格。现在的版本有A、B、C、D、E、F个版本，认证的时候，按照对应的版本做记录，审核通过了。现在关键是如何整合，而咨询的老师不让通过后把所有的合在一起，说是年审时有问题。现在公司每次在审核时都做不同版本对应的记录，苦死了，剩下的是每年要有6次年审，那么对记录就的做6个版本的，该多苦啊，各部门的人抱怨连天。现在公司的这项活动让我解决，请教我该如何规范？