质量手册的问题

请教大家一个问题：
我们公司正在做质量体系，因为国家对我们行业有特殊的要求，必须按照它的体系要求来编写质量手册，但我们公司又要通过比如ISO9000或者TS16949的认证，请问质量手册要两本或是就一本来兼容两者？
但如果兼容的话行业的体系要求和ISO的是有很大区别的.可能难以写质量手册。但如果按两本来做的话，无法知道究竟该按哪本来执行？
谢谢！