程序文件的作用

公司在ISO换证的准备阶段，目前的程序文件我仔细阅读了好几遍，没有任何的问题，不过因为执行力的问题，各部门运作运作还是不会按照程序文件来实行，因此，
老总要求：对程序文件做修改，要适合公司的实际运作，且让各部门部门长自己修改，这样就不会出现不能执行的问题了！
本人认为：程序文件是起到提高和约束的作用的，如果都是要适合公司目前流程而制作的程序文件，基本不能起到约束作用，何况程序文件让各部门自己修改自己的部分，会造成免责的很多，而约束的部分就会流失，所以很疑惑！
请大虾们发表自己的意见，我将会对你们的意见加以重视，谢谢！