改全套质量体系程序文件,版本如何变更?

当初刚接触质量体系时还没觉得什么不完善、不适宜。但越来越多的客户稽核后，我发觉好多程序文件已经不能满足现有客户的要求及自身的品质管控要求，还有很多新的程序要单一的添加进来。所以最近自己在考虑改一整套的程序文件，最近也联系了先前的认证公司，他们那边没意见，以前是ISO9000和ISO14000整合在一起的，现在也不打算分开，只是要加入很多内容和部分程序文件，包括更改文件和质量记录的编号。
如果对这些更改按文件控制程序来操作的话，那动作就会很大，也会觉得很乱，所以想请教大家，如果不考虑先前的那些程序，按公司现有情况重新制作一套出来，那版本号如何变更？(以前程序文件最初版本都是A0):D