管代变更

体系目前遇到一个大难题：
1、公司在大断发展，最近组织机构调整过于频繁，一年内已调整了3次，在08年11月，确定了新的组织架构。
2、变更的架构与原组织架构相差悬殊，且体系管理部门进行调动，体系管理职能部门的调动，导致管理者代表需变改，这是实际操作中已经明确的，但需提出的是，未有人事调动令变更管理者代表。
3、对一些修订后的程序文件，或记录表或三级文件，出现不知找谁签名的情况，而且职能的变动，导致体系文件与实际的职能部门不符。

目前迫切需要更新ISO文件，新任命管理者代表，但同时也想到，ISO9001：2000很快就是被ISO9001：2008代替，我该怎么办！！！请高手指点迷津，万分感谢！！！