关于ISO9001：2008更换版本如何操作

公司5月份要进行管理内审了，我建议在做管理内审的时候直接把2000版本相关的问题更换成为2008版本好了。可是公司的高层一定要我把修改的内容都体现在质量手册上面---是我自己建议的。因为公司是做TS的，但是遗憾的是咨询公司把ISO9001和TS16949分别给2家不同得到认证公司做的，那时候是公司开业初始也没有人对这个发出异议。所以，我们是既要做ISO9001又要做TS16949.
我的问题是我有必要把2008版本修改的内容逐一体现在质量手册里面吗？