一張ISO證書，程序文件可以分開嗎？

總公司和分公司共用一張TS/ISO證書，即分公司是延伸認證。
我們的一、二階文件都是一樣的，三階文件不一樣，但是也是統一管控。三階以下文件無大問題。
總廠的管理代表今天一席話讓我感慨良多，“以後的文件分開管理，文件修改各自審批。”請問可以嗎？分廠沒有營業部門、沒有設計開發部門、采購也沒有、一切都是總廠同一管控，一句話就分開了，難道不要做一下求證？不開會討論下細節？
再此不討論文件管控，這裡存在很多推卸責任的問題。
只討論，可否共用一張證書，而兩種管理方式呢？已經問了認證公司，但是未回覆。