关于9000体系二阶三阶事宜

现在我所在的一家公司的是这样做的，请问大家是不是合理：
1.ISO9000里有规定六个基本文件必须有，那现在是公司为了外审，只写了这六个文件，条款里其它项目都写到了三级文件里去了，比如设备设施管理程序，过程管理程序等等，都写入三级程序，公司说外审人家只审二级程序，三级文件可以不审，是这样吗？
我的观点是：三级文件是SOP，SIP，二级文件的细化，他现在有执行的一些动作的条款里有规定那他就得在二级文件体现，如果写三级文件就是不合理的，
2.公司为了税的问题，只是可能，把公司分成了二部分，其实是 一家公司，一个贸易，卖原材的，一个是加工产品的，且有两个公司名，两个公司的文件是写在一块的，且公司名在文件里台头两家公司写在一块的，且受控章都有两个公司的，在一页盖的，