关于公司内质量体系推动问题

各位前辈：

我今日遇到一个问题，就是我现在的公司之前已经通过认证，但是证书上写的认证公司为：XXX集团XX省分公司，我们分公司下设两个基地，A基地，B基地.两个基地相隔150公里。但是我们两个基地使用同一份手册、程序书，但是现在BXXX机构发生变更，A基地没有变更，操作起来相当困难。最关键的是管理者代表在A基地，总经理在B基地，且不经常走动。我来了还没见过管代，郁闷！

这样做出现的问题就是很乱，乱上加乱，造假没有意义。我想咨询一下

1、我们两个基地是不是可以各自做各自的体系，但是认证还是只认证一个主体？