体系文件请教

请问各位前辈们：****分公司，分为A地和B地两个生产基地，A、B两地是否可以编制各自的一套体系文件，有无特别要求？我是A地的质量体系管理员，刚做1年。
目前A、B是编制了1套文件（我们请的咨询公司说应该编制一套文件，因为****分公司经营范围具有生产、销售、研发等，），即质量手册（涉及到的组织结构都做了统一，但仅限于文件中，现实A、B两地部门名称及职能略有区别）、程序文件是共用的，三层文件及记录表格各自编制，可是现在看来很不适用，因为两地的产品不同，组织结构也略有不同，工作流程也略有不同，很难统一。现在A地，我的直接领导考虑让我编制自己A地的一套文件，外审时用A、B共用的1套文件，自己内审时用自己的1套文件，但是我很担心会乱套，因为目前公司中层领导都还没有明白或接受质量体系这回事，现在也只是应付的态度，如果再弄一套文件，可能会更糟，因为涉及到工作流程、文件及记录编号都要改。我是想标准中规定的6个必须程序文件和B地统一，其余的都编成3层文件，可是领导又不愿意。所以现在我也很混乱，不知该怎么办。头都大了。