体系建设从何入手

我是刚毕业的大学生，从事体系方面的工作。
刚进工厂发现一片混乱，每一个问题总牵扯到各个部门的方方面面，每一方面又似乎都是问题的难处，不知从何入手，从哪一个方面作为切入点来解决，建立并维护体系。就拿执行力来说吧，车间总是利用各种各样的现实条件的制约来开脱，更心烦的是那些理由还很有道理，让我不知所措。
还请高手指点一二！不胜感激！