如何根据情况平衡供应商审核的程度

供应商审查、驻场检验及作为第三方检验，三者有哪些方面的不同？检验的程度有哪方面的差异？怎么去平衡各方的利益？

作为产品的审查，在我的印象中，如果想查的话都可以查的出问题；很小的问题大家都是存在的。当然我经历过，3次第三方的审查，每次多少都会存在问题，也都不有不符合项的出具；然后进行整改，第三方的检验是可以通过的。

现在的问题是，我作为审查方去查我们的供应商。这家供应商做的产品是和我们的产品相同，只是规格的问题。我负责去供应商那里去确定出货前的检验。因为产品相同、生产工艺相同，所以对整个检验非常熟悉。经检验，产品质量过关，小的质量问题可以维修后接受；对文件进行检查时发现大部分都是造假的（很明显），而且也存在很多不合格的地方；我的处理是让他们进行改正。不知道此做法是否正确？另外，我自己也知道很多的像计量器具方面的也没有进行检查。公司的程序文件也没有进行。
对于此类的检验，主要检验在哪方面？

另外作为认证机构的话，根据9000要素要去检查各个方面的；那么作为供应商检验、第三方的检验等主要是从哪方面进行？哪方面是重点？哪些是次要的呢？

静待各位大家赐教