人事行政制度包含在质量体系文件么？

有个问题比较困扰我，希望大家能解答一下。

我们公司人事部专门编制了一本人事行政制度，包括了聘用规定、考勤制度、请假制度、离职、考核、薪资、员工福利、保险规定以及其他一些的后勤制度和安保制度，并且印刷成员工手册的形式发放给所有员工。

我们公司质量管理体系做的TS16949，质量部经理认为这是质量体系内的，要求把整本的人事行政制度依照6.2条放入三级文件，包括总经理也是这样认为的，但是我总觉得有点不妥，我一直的观念是每个公司不应该只有质量管理体系的，其他还应该有生产管理体系、人事管理体系等等一系列的体系，其实这些东西你要是硬扯，总能扯到质量体系里的，但总不能把所有的东西都放到体系文件里吧？

当然这样做并不会造成什么实质性的管理混乱和后果，并且总经理都这样认为了，我也没必要去反对，但我想知道这样做到底合不合理呢？