求助~！！！！PCB板合格率 问题 以及赔偿问题

我公司2月份到货的1000块PCB板（6层板）贴片后检测发现 BGA 处发开路不良2块、短路不良1块；当时检测问题的时候我们没有第一时间怀疑到PCB板上，经反复检测板子上的元器件没有问题后，我们才开始对PCB板进行测试才发现原来是板子的问题。在电子行业中,PCB工厂的PCB板合格率有没有个什么标准??一般合格率为多少?电子行业中对这个是标准是根据什么去制定的?
PS：故障是在产线测试时发现的；我们板子上贴片用的一些芯片、模块都是用的很贵的，国外进口的


以下是我们供应商的赔偿协议。：“望贵司能够给予我司0.3%的允许不良比例，在范围内的不良不追究我司责任，我司补空PCB给贵司。2、对于超出0.3%不良比例的不良品，请贵司将可使用的贵重元件折下后，其余物料成本由我司承担。”


请问这个赔偿协议合理吗？