FMEA,CP特殊特性转换问题

新到这家公司，体系之烂无法言语，报道一周TS审核，记了8项缺失，其中两项比较头疼，回复出去审核老师说真因分析不够深入，要重新回复，郁闷！在此请教高手们：

1、Flow Chart中特殊特性与FMEA和CP不一致
（我随机看了几份，就没有完全一致的，my god！FMEA和CP都是受控文件，Flow chart是不受控的，可既然不受控，怎么又摊出来给人家看了呢？看就看了，跟老师讲一下嘛！项目的人不知道这是非受控的！
很担心水平展开的问题，展开不得死人了）
回复的原因：负责人员未确认Flow chart中的特殊特性与FMEA的吻合度 （没有提Flow chart不受控的事）
对策：
1) 修改flow chart，确认特殊特性一致
2) 人员培训
3) 该项修入内审checklist


2、CP中提到的量测仪器显微镜没有做MSA
我写的原因是：
1)没有流程定义哪些需要做MSA，我们只针对涉及特殊特性的量器做了MSA；
2)人员对MSA的理解不够；
对策是：
1) 针对显微镜做GR&R；
2) 建立MSA管理表，针对CP中提到的量测仪器，制定MSA频率并按期实施
3) 相关人员MSA培训
4) 内审checklist 量规仪器管制流程checklist加入该项

唉，高手指教一下怎么回复比较好，谢谢！