废水检测取样问题

今天遇到一个两难的问题，对于公司的ISO14001执行，公司废水和噪音每年都会请第三方检测机构检测，我今年是第一次联系第三方检测机构，他们给我两个选择，一是由检测机构到我们公司来取样，二是由我们把废水装在瓶子里快递给他们，这两个的价钱是不同的，那对于公司肯定选择性价比好的额，可是对于第二种把废水送到检测机构检测要考虑什么问题吗？这样是合理的吗？请大家帮忙，谢谢！