如何做好过程管理？

我司是一家注塑制品厂，从9月份开始正式运用了过程管理方法，但效果一直都不是很理想，今天品管部经理召集各个部门开会讨论，期间管生产的经理提到了几个问题让大家感觉到制造部所承受的压力比较大，第一是产品包装问题，因为物流部为考虑到节约成本，通常都会提供与BOM不一致的包装材料代替，而且又不提前通知生产部门，导致品管部IPQC人员发现不符后开单；第二是作业指导书问题，工程部不能及时完成生产作业指导书并下发导致生产时经常无作业指导书操作，品管部IPQC人员发现后只会开单给制造部。制造部认为这两个问题都不是他们的问题，给他们带来了困扰，对于此现象IPQC人员应该如何处置才合理呢？请各位同行发表高见，将不胜感激！