企业重组，体系认证的问题

各位，大家好。
不知道大家有没有碰到过企业重组对于体系认证的影响。我现在所在的是一家新公司，这家新公司是由原来我所在的老公司和另外一个国企里剥离出来的业务进行重组而成的。
现在的问题是，有个重要客户（年内肯定还会来不少）来公司进行审核，这样的话，新公司还正在进行体系认证，重组前的两家公司的证书都无法使用在这个新的公司里。
这样的情况，大家伙是如何解决的。

另外，客户的审核不符合项中已经提到质量手册没有新版本，体系目标没有更新等等问题。不知道大家是如何解决的。
谢谢。