这样的放行怎么处理?

公司二分厂在使用一批铝材时发现铝材尺寸不对,铝材是由公司物控部下料生产的,于是二分厂在产品还未交付到我部门(质管中心)总检处(负责产品入库验收)时就向营销事业部副总申请了让步放行并且得到批准同意放行,生产出来后交付我部门总检处验收,抽检数为9套产品(显然都是有铝材尺寸不对的不合格的),检验均记录为不合格,现在我在质量周报上计算二分厂的合格率时把这9套产品也作不合格计了,他们的质检科长过来说不应该计入他们的不合格中,而应批量计入到物控部,因为他们交过去的产品是批量的不合格的,而不是9件不合格,我没晕死:(,但是我还是有点不明白,请各位发表意见,给点建议:(,这种情况到底该怎么处理.我现在说到时在质量月报时把它调整过来.