不良改善问题，求指点

刚到一家公司，面试时交待主要改善公司制程问题，降低不良率，数据都有，每天的报表记录下来，都不用去做柏拉图就能直接看出前三大不良，针对前三大不良，我每天在现场跟踪及造成原因，发现一个很郁闷的问题，找不到真实原因，求高手指点。谢谢！ 
实例：半成品100%进行功能检测，专门测试发光条颜色转换，及颜色一致性，不良率3%，可到成品检测时不良率居然上升到5%，说明下，1.发光条装在透明PC面壳凹槽里，后面只装主板，及底面壳互配，都是连续生产。
我做过如下分析及事情：
1.对原材料进行检测，合格，包括发光时间，颜色转换次数及一致性。
2.半成品测试工位漏检，在线上呆了整整三天，检测工位100%确认，流下去的产品无漏检现象，且功能正常，
3.半成品与成品检测标准不一致，工位都有样品，且对不良现象判定一致，排除标准不一致问题，
4.对检测后五道工序进行监控，1装主板，2主板打螺丝，3底壳与面壳互配，4底面壳打螺丝，5成品测试。未发现有直接关联现象。